Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp12Q9D9M2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms