Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot8Q9D8X5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms