Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Derl3Q9D8K3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Derl3Q9D8K3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Derl3Q9D8K3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Derl3Q9D8K3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms