Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jam3Q9D8B7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms