Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1Q9D883 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2af1Q9D883 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1Q9D883 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms