Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc39Q9D5Y1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms