Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc130Q9D516 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms