Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3404Q9D506 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3404Q9D506 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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