Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp4Q9D4F8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms