Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms