Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sohlh2Q9D489 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sohlh2Q9D489 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms