Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D454 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D454 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D454 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D454 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D454 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D454 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D454 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D454 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D454 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D454 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D454 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D454 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D454 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D454 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D454 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D454 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D454 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D454 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D454 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D454 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D454 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D454 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D454 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D454 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D454 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D454 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D454 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D454 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D454 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D454 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D454 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D454 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms