Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4cQ9D3F6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a4cQ9D3F6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4cQ9D3F6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms