Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stag1Q9D3E6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag1Q9D3E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag1Q9D3E6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms