Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy3Q9D394 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rufy3Q9D394 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms