Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms