Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap5-3Q9D226 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms