Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eef1e1Q9D1M4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eef1e1Q9D1M4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms