Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ribc1Q9D0B8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms