Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mms19Q9D071 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mms19Q9D071 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mms19Q9D071 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms