Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Elp3Q9CZX0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elp3Q9CZX0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1231.7 ms