Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thumpd2Q9CZB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms