Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hcfc1r1Q9CYQ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms