Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssu72Q9CY97 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssu72Q9CY97 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms