Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mis12Q9CY25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mis12Q9CY25 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms