Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3100002H09RikQ9CXW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.2 ms