Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms