Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf1Q9CWX2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf1Q9CWX2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms