Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Malsu1Q9CWV0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms