Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc3Q9CW03 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smc3Q9CW03 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms