Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms