Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six6os1Q9CTN5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six6os1Q9CTN5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six6os1Q9CTN5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms