Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms