Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms