Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd2aQ9CQJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd2aQ9CQJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms