Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl11Q9CQF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl11Q9CQF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms