Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rpl39lQ9CQD0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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