Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp2Q9CQ73 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms