Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl49Q9CQ40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl49Q9CQ40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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