Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp3Q9CQ10 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms