Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc18Q9CQ07 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc18Q9CQ07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms