Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930519G04RikQ9CPT7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930519G04RikQ9CPT7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms