Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tomm22Q9CPQ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms