Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim8Q99PJ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim8Q99PJ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms