Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ms4a6cQ99N08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ms4a6cQ99N08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ms4a6cQ99N08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a6cQ99N08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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