Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr3Q99MB1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms