Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprtQ99M80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PtprtQ99M80 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PtprtQ99M80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
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