Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt84Q99M73 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt84Q99M73 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt84Q99M73 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms