Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q99KU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q99KU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q99KU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q99KU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q99KU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99KU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99KU6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99KU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99KU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99KU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99KU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99KU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99KU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms