Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lactb2Q99KR3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lactb2Q99KR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms